南京土壤研究所现有土壤与农业可持续发展国家重点实验室、土壤养分管理国家工程实验室、农田土壤污染防控与修复技术国家工程实验室、中科院土壤环境与污染修复重点实验室、农业部耕地保育综合性重点实验室等重要研究平台；设有土壤资源与信息、土壤地力与保育、土壤环境与修复、植物营养与肥料、土壤生物与生态等5个研究部以及土壤资源与遥感应用、土壤－植物营养与肥料、土壤化学与环境保护、土壤物理与盐渍土、土壤生物与生化、土壤与环境生物修复、土壤利用与环境变化等研究单元；还拥有土壤科学数据中心（中国生态系统研究网络土壤分中心）、河南封丘农田生态系统国家野外科学观测研究站、江西鹰潭农田生态系统国家野外科学观测研究站、江苏常熟农田生态系统国家野外科学观测研究站、中国科学院三峡工程生态环境湖北秭归实验站。此外，拥有联合国粮农组织的特约图书馆和亚洲最大的土壤标本馆；土壤与环境分析测试中心是国家质量技术监督局认定的国家计量认证合格单位。南京土壤研究与31399金沙娱场城长期达成战略合作，批量采购便携式土壤重金属检测仪，为土壤与环境分析做出一份力量和贡献！

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